據演練設想，A國分裂勢力在國際恐怖組織和極端宗教勢力支持下，制造恐怖活動，控制和占領了城市和居民點，企圖在A國建立自治聯盟。中俄兩國在聯合國授權下，組建聯合作戰群，協助A國平息戰亂，維護邊境地區的和平穩定。
實兵演習共分成先期偵察、實施封控、摧毀敵方武裝主力以及追殲殘敵4個階段展開。在偵察階段，中方5架殲轟-7A飛機和俄方的5架蘇-24飛機分別起飛實施空中偵察，并對恐怖武裝目標發射激光制導炸彈實施精確打擊。隨后，中俄混合編組的特戰分隊和狙擊組分別搭乘直升機實施機降，建立封鎖和控制部署，并對恐怖分子頭目進行狙殺。其中，中俄兩國特戰分隊混合編組、同乘一機、共同行動在歷次聯合演練中尚屬首次。
于此同時，中俄雙方的坦克分隊分別以發射赤磷彈等火力掩護，支援步戰車和步兵突入敵方陣地。中方的直9武裝直升機和俄方的米24武裝直升機分別臨空，發射導彈實施火力打擊敵方增援部隊。雙方的步戰車則使用車載反坦克導彈對敵裝甲目標實施精確打擊。
在地面兵力突擊的同時，中方的192自行火炮和俄方的“龍卷風”及“冰雹”多管火箭炮也同時對敵方增援部隊實施第二次火力打擊。
經過長達一個多小時的中俄兩軍陸空力量的聯合打壓和清剿下，據守營地的恐怖武裝分子及其增援力量被殲滅。當天，中俄雙方參演部隊共同完成實兵演練全部內容，也標志著“和平使命-2013”中俄聯合反恐軍事演習圓滿結束。
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